Ο τρόπος διεξαγωγής της διαμεσολάβησης για τις οικογενειακές, αστικές και εμπορικές υποθέσεις ρυθμίζεται από τις διατάξεις του ν. 4640/2019. Παρόλα αυτά υπάρχει ευελιξία στην διαδικασία που θα ακολουθηθεί μετά από συνεννόηση και συμφωνία των μερών, ανάλογα με την φύση και τις ιδιαιτερότητές κάθε διαφοράς και τηρώντας τις βασικές αρχές της διαμεσολάβησης περί ουδετερότητας, αμεροληψίας, εχεμύθειας και απορρήτου.
Είναι μία εκούσια διαδικασία, που σημαίνει ότι τα μέρη βρίσκονται εκεί με την θέλησή τους και έχουν την δυνατότητα να αποχωρήσουν ανά πάσα στιγμή το θελήσουν.
Η συνήθης διαδικασία, χωρίς αυτό να είναι δεσμευτικό, θέλει τα μέρη (ή όταν πρόκειται για νομικά πρόσωπα, τον νόμιμο αντιπρόσωπο ή εκπρόσωπό τους) να πραγματοποιούν μία κοινή συνάντηση με την παρουσία των πληρεξούσιων δικηγόρων τους και του διαμεσολαβητή. Σκοπός της κοινή συνεδρίας είναι η ενημέρωση των μερών για την διαδικασία και τις αρχές της διαμεσολάβησης. Στην συνάντηση αυτή έχουν της δυνατότητα εφόσον το επιθυμούν να εκθέσουν τις απόψεις τους για την διαφορά.
Εάν αυτό κριθεί απαραίτητο υπάρχει η δυνατότητα να πραγματοποιηθούν ιδιωτικές συνεδρίες με κάθε μέρος ξεχωριστά. Μέσα από τις συζητήσεις αυτές ο διαμεσολαβητής, θα είναι σε θέση να γνωρίσει σε βάθος τη φύση της διαφοράς συλλέγοντας περισσότερες πληροφορίες γι αυτή και φιλτράροντας τις εντάσεις και τους συναισθηματισμούς. Στόχος του είναι να αναδείξει τα κοινά τους συμφέροντα.
Χρησιμοποιώντας τις τεχνικές της διαμεσολάβησης και τις ειδικές του γνώσεις θα προσπαθήσει να διευκολύνει την διαδικασία, την επικοινωνία και τις διαπραγματεύσεις μεταξύ των μερών. Μπορεί επίσης να μεταφέρει στην κάθε πλευρά τις πιθανές προτάσεις της άλλης, φυσικά μόνο έπειτα από την ρητή συναίνεσή τους.
Εάν τα μέρη καταλήξουν σε μία αμοιβαία αποδεκτή λύση, με την συνδρομή των δικηγόρων συντάσσεται ένα πρακτικό επίτευξης, το οποίο περιλαμβάνει και την συμφωνία με τους επιμέρους όρους της. Το πρακτικό υπογράφεται από τα μέρη τους δικηγόρους και τον διαμεσολαβητή. Στην συνέχεια το πρακτικό επίτευξης της συμφωνίας κατατίθεται στην γραμματεία του καθ’ ύλην αρμόδιου δικαστηρίου ώστε να αποτελέσει εκτελεστό τίτλο, εφόσον κάποιο από τα μέρη το επιθυμεί.
Στην αντίθετη περίπτωση ο διαμεσολαβητής συντάσσει πρακτικό μη επίτευξης συμφωνίας